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Points clés à retenir
- L’hôpital pour enfants de Los Angeles a mené la plus grande enquête génomique pédiatrique sur le COVID-19 à ce jour.
- L'étude rapporte un lien possible entre certaines mutations du SRAS-CoV-2 et la gravité de la maladie.
- Les échantillons ont montré des niveaux élevés de variation génétique en Californie.
Comme de nombreux virus, le SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, subit de nombreuses mutations génétiques à mesure qu'il se propage dans une large population. Les scientifiques commencent à peine à comprendre ces variations et leur impact sur la santé, en particulier chez les enfants.
Dans la plus grande étude génomique pédiatrique sur le COVID-19 à ce jour, une équipe de l’hôpital pour enfants de Los Angeles a découvert un lien entre les mutations virales et la gravité de la maladie. L'étude de novembre a été publiée dans la revueForum ouvert sur les maladies infectieuses.
«Si nous pouvons faire quelque chose pour savoir s'il existe une corrélation entre la génétique de la mutation du génome viral et le phénotype de la maladie (les caractéristiques observables du COVID-19), vous pouvez être informé de la meilleure façon de traiter le patient», Xiaowu Gai , PhD, l'un des auteurs de l'étude et le directeur de la bioinformatique à l'hôpital pour enfants de Los Angeles, raconte Verywell.
Afin de mieux comprendre comment la variation génétique pourrait affecter une population pédiatrique, l'équipe de recherche a analysé les informations génétiques du virus de 141 enfants infectés entre le 13 mars et le 16 juin. Ces échantillons ont montré un niveau élevé de variation et la prévalence d'un virus commun. mutation associée à des taux de transmission plus élevés.
Ce que cela signifie pour vous
Le matériel génétique du SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, est en constante évolution. Les scientifiques s’efforcent de comprendre comment les mutations génétiques peuvent affecter la transmission du virus et la gravité de la maladie chez les patients infectés.
Un virus en constante évolution
Les mutations sont des erreurs qui se produisent dans le génome du virus - ou dans le matériel génétique - lors de sa réplication. La plupart des virus subissent certaines variations lorsqu'ils circulent dans une population. Dans le SRAS-CoV-2, de nombreuses mutations sont insignifiantes ou peuvent même affaiblir le virus. D'autres, cependant, peuvent affecter la facilité de transmission du virus et même la gravité de la maladie.
«Quand beaucoup de gens pensent au COVID-19, ils pensent à cette seule chose, à cette singularité», dit Gai. «Mais ce n’est pas ainsi que nous le voyons. Le virus présent dans le corps de tout patient atteint d’une infection virale est un mélange de nombreuses copies différentes de ce virus. »
Une mutation commune, appelée D614G, provoque des changements dans la protéine de pointe du virus. Bien qu'elle n'était pas répandue lorsque le virus a commencé à se propager dans le monde plus tôt cette année, la version est depuis devenue dominante dans le monde entier. Les auteurs rapportent qu'il était présent dans 99,3% des échantillons pédiatriques qu'ils ont collectés.
La mutation D614G, qui augmente la protéine de pointe utilisée par le virus pour pénétrer dans les cellules humaines, permet au virus de se transmettre plus facilement. Il n'y a pas encore de preuve concluante que cette mutation modifie la gravité des symptômes de la maladie.
La protéine de pointe COVID-19 médie l'entrée du coronavirus dans la cellule hôte.
L'équipe de recherche a cependant trouvé un lien entre le clade 20C - une version mutée du virus - et des symptômes plus graves. Les clades 20A, 20B et 20C sont tous des versions récemment mutées du virus. Tous les cas pédiatriques sévères et tous les cas modérément sévères sauf un dans cette étude portaient une version du virus avec le clade 20C.
Implications des mutations
«Lorsque le public regarde une déclaration comme celle-ci, il semble effrayant que le virus mute», a déclaré à Verywell Stuart Campbell Ray, MD, spécialiste des maladies infectieuses et professeur de médecine à l'Université Johns Hopkins. «Mais tous les virus à ARN ont un taux de mutation. Et le taux de mutation du SRAS-CoV-2 est environ cinq fois plus lent que celui de la grippe, du moins jusqu'à présent.
Ce taux de mutation relativement lent peut être utile pour les scientifiques qui tentent de maîtriser le nouveau virus. Cependant, Ray prévient qu'au fur et à mesure que la population de personnes infectées augmentera, la vitesse à laquelle les mutations se produiront augmentera également.
Avec l'introduction de solutions pour soutenir le système immunitaire contre l'infection virale - comme la vaccination, l'exposition préalable au virus, le plasma de convalescence et la thérapie par anticorps - le SRAS-CoV-2 peut évoluer pour échapper aux réponses immunitaires. Cela signifie qu'il est possible que les vaccins candidats qui sont actuellement prometteurs deviennent moins efficaces dans les mois à venir à mesure que le virus continue de muter.
«Il existe un risque - parce que cette pandémie est incontrôlable - que ces mutations s'accumulent et que les bonnes mutations puissent se produire et échapper aux réponses immunitaires», explique Ray, qui n'est pas affilié à l'étude.
Les vaccins qui se sont avérés efficaces protégeront probablement le corps contre le virus. Mais, comme c'est le cas pour d'autres virus répandus comme la grippe, des versions supplémentaires ou nouvelles du vaccin peuvent être nécessaires pour couvrir toute nouvelle souche du virus qui émergera à l'avenir.
Gérer les variables inconnues
Bien que le COVID-19 soit souvent signalé comme moins grave chez les enfants que chez les adultes, un enfant sur trois hospitalisé pour la maladie est admis aux soins intensifs, selon l'étude. Gai dit que pour les patients qui connaissent une évolution sévère de la maladie. maladie, la compréhension de la composition génétique du virus pourrait fournir des informations clés pour le développement du traitement.
Pourtant, la composition du virus lui-même ne peut que dire aux généticiens comment il affectera les personnes infectées. Ils doivent également tenir compte des données démographiques et génétiques de la personne infectée.
Gai avertit que si ces résultats peuvent suggérer une corrélation entre certaines mutations et leurs résultats, de nombreuses études plus importantes sont encore nécessaires pour montrer qu'une mutation provoque définitivement une maladie plus grave. Bien qu'il s'agisse de la plus grande enquête génomique pédiatrique sur le COVID-19 à ce jour, elle n'a inclus que 141 enfants.
«Ce n’est pas vraiment un très grand échantillon», dit Gai. "Nous ne pouvons pas faire l'analyse de corrélation pour chaque mutation individuelle avec un phénotype de maladie."
De plus, l'étude n'a pas tenu compte des différences d'âge, de sexe, de conditions préexistantes et d'autres facteurs importants. Les résultats liés à la charge virale des patients peuvent également être biaisés en fonction du moment où les échantillons ont été prélevés sur les patients. Pourtant, l'étude contribue à un corpus croissant de connaissances sur la façon dont la variation génétique peut façonner d'importants résultats pour la santé.
«Nous avons besoin de rapports comme celui-ci pour avoir une idée de la façon dont le virus évolue», dit Ray. «Les séquences d'études comme celle-ci, associées à des séquences du monde entier, ont une valeur majeure pour nous aider à comprendre comment ce virus évolue et si nous devons ajuster nos stratégies pour le gérer.»
