Makeda Robinson, MD, PhD, est un spécialiste des maladies infectieuses qui étudie actuellement les interactions virus-hôte dans les virus émergents à l'Université de Stanford. Chaque semaine, le Dr Robinson décompose des sujets complexes sur le COVID-19 et aborde des problèmes de santé publique urgents.
Alors que les efforts scientifiques pour éliminer le SRAS-CoV-2 s'intensifient, la structure et les activités du virus s'intensifient. Nous faisons tout ce qui est en notre pouvoir pour maintenir le SRAS-CoV-2 hors de la carte, alors il fait tout ce qui est en son pouvoir pour y rester. Principalement: c'est en train de muter.
Que signifient ces mutations? Vont-ils nous prouver plus dangereux que le virus d'origine, ou s'agit-il d'occurrences bénignes? Plus important encore, comment ces mutations affecteront-elles nos efforts actuels de traitement et de vaccination? Le Dr Robinson a parlé avec Verywell Health de la science derrière les mutations virales et de ce qu'elles signifient pour l'avenir du SRAS-CoV-2, ainsi que des efforts pour l'identifier et l'éradiquer.
Vaccins COVID-19: Restez à jour sur les vaccins disponibles, qui peut les obtenir et leur sécurité.
Verywell Health: Pourquoi un virus mute-t-il?
Dr Robinson: Les virus, comme les humains, sont soumis à une pression évolutive constante, le but d'un virus est donc de survivre et de se multiplier. Les mutations qui surviennent dans un virus sont souvent une réponse aux différents efforts de notre système immunitaire pour l'identifier et le neutraliser. Chaque fois qu'un virus se réplique, des mutations aléatoires sont effectuées dans son génome. Cela se produit plus fréquemment dans les virus à ARN comme le SARS-CoV-2 par rapport aux virus à ADN comme les virus de l'herpès, avec lesquels nous vivons depuis plus longtemps.
Des virus comme le SRAS-CoV-2 et le virus original du SRAS ont sauté dans les humains à partir d'autres hôtes animaux. Quand ils ont infecté les humains pour la première fois, c'était comme un tout nouveau monde pour eux. Ils ont dû apprendre à s'adapter et à changer dans un environnement qui tente de les rechercher et de les tuer, déclenchant un scénario de «survie du plus apte». Chaque virus aura ses propres capacités à naviguer dans le système immunitaire humain, et les souches avec les meilleures tactiques d'évasion deviendront dominantes.
Si la mutation conduit à une infection qui est rapidement mortelle, elle fera trop de mal à l'hôte, perdant ainsi l'opportunité d'infecter d'autres membres de la communauté. De cette manière, le virus peut rapidement s'éteindre et il est peu probable qu'il provoque une pandémie mondiale.
D'un autre côté, si le virus est trop faible, notre système immunitaire le détectera et le tuera rapidement, empêchant ainsi le virus de se répliquer et de se propager à d'autres.
Il existe un endroit idéal pour un virus où il peut infecter et se propager aussi efficacement que possible. Plus il a de temps pour évoluer avec nous, mieux il s’adapte à nos défenses.
Verywell Health: Les mutations virales sont-elles toujours une mauvaise chose?
Dr Robinson: Les mutations virales ne doivent pas nécessairement être une mauvaise chose; il s’agit d’un processus naturel qui se produit au cours du cycle de vie viral. En fait, la plupart des mutations sont des changements complètement bénins. Les virus passent par le processus de sélection naturelle, où les souches virales les mieux équipées pour prospérer dans un nouvel environnement l'emporteront. Suivre ces changements, d'une certaine manière, c'est comme assembler un arbre généalogique et comprendre en quoi chaque branche est différente, mais liée à l'autre.
Cependant, à mesure qu’un virus commence à dériver de sa séquence initiale, nous devons être plus prudents quant aux méthodes de prévention et aux traitements que nous proposons. Si ces interventions visent le virus lui-même, elles ne fonctionneront peut-être pas toutes aussi uniformément qu'elles l'auraient fait auparavant. Au fur et à mesure que le virus se familiarise plus profondément avec son hôte, ses défenses changent en conséquence. Nous devrons donc être encore plus réfléchis à la façon dont nous concevons les thérapies que nous n'aurions dû l'être plus tôt lorsque le virus était plus homogène. Un traitement qui aurait bien fonctionné en avril pourrait ne pas avoir le même effet en octobre, car le virus a évolué.
Verywell Health: Y a-t-il eu des mutations dans le SRAS-CoV-2?
Dr Robinson: Le virus a développé plusieurs mutations qui circulent actuellement dans la population. Une étude récente qui a séquencé plus de 7 000 génomes a identifié 198 mutations récurrentes différentes.
Bien que de nombreuses mutations soient inoffensives, les chercheurs ont trouvé une mutation spécifique dans la protéine de pointe - la partie du virus qui s'accroche aux cellules humaines - qui est maintenant devenue la souche mondiale dominante du virus. Cela signifie que lorsque nous regardons le génome original qui a été séquencé à Wuhan, en Chine, cette séquence génomique particulière n'est plus la plus courante, et cette nouvelle protéine de pointe est maintenant la souche dominante. La mutation a été nommée G614, ce qui signifie qu'il y a eu un changement dans l'acide aminé à la 614e position.
De nombreux vaccins en cours de développement ciblent la protéine de pointe, donc si nous constatons un véritable changement dans la séquence de la cible, nous devons être extrêmement prudents quant à ce que nous qualifions de «réponse suffisamment neutralisante» en clinique vaccinale. essais.
Je pense que nous devons également réfléchir à la polythérapie et continuer à développer d'autres approches en parallèle. Identifier les zones du virus qui sont cohérentes entre les souches peut fournir nos meilleures chances de concevoir les meilleurs traitements et vaccins pour l'avenir. Si nous envisageons d’avoir une seule cible spécifique, nous devons nous demander si cette approche continuera de fonctionner alors que le virus continue de s’adapter et de changer.
Verywell Health: L'une de ces mutations a-t-elle rendu le virus plus mortel?
Dr Robinson: Nous sommes toujours en train d'apprendre les facteurs de virulence associés aux souches émergentes. Certaines de ces mutations peuvent entraîner une augmentation du taux d'infection ou de réinfection.
Le premier cas de réinfection a été récemment décrit à Hong Kong. Le patient a été initialement infecté par une souche virale similaire à la souche originale de Wuhan, puis a été infecté quatre mois et demi plus tard avec une souche virale différente. La souche de la réinfection contenait la nouvelle mutation de protéine de pointe, qui a été associée à une maladie plus grave.
Une récenteCelluleL'article a examiné de plus près cette mutation spécifique, appelée G614, et a constaté que les personnes infectées par un virus contenant la mutation G614 avaient une durée d'excrétion virale plus longue. Cela signifie qu'ils étaient contagieux pendant une période plus longue. Les chercheurs ont également découvert que lors de l'infection de cellules en laboratoire, le virus G614 présentait une augmentation jusqu'à neuf fois de l'infectiosité par rapport à la séquence d'origine de la protéine de pointe, appelée D614.
Verywell Health: Si quelqu'un acquiert l'immunité contre le SRAS-CoV-2, y a-t-il une chance qu'il ne soit pas immunisé contre une souche mutée du virus?
Dr Robinson: Le cas de réinfection a soulevé d'importantes questions quant à savoir si ces nouvelles mutations peuvent affecter la façon dont le virus déclenche nos réponses des cellules B et T, qui sont les cellules immunitaires dont nous avons besoin pour combattre le virus et développer des anticorps. Plusieurs des mutations observées dans le cas de réinfection ont la capacité d'interagir avec le système immunitaire adaptatif. Cela soulève des inquiétudes quant au fait que la réponse immunitaire que certaines personnes ont développée au virus SARS-CoV-2 initial au printemps puisse être différente des réponses nécessaires pour monter une réponse efficace au virus SARS-CoV-2 qui circule actuellement. Cela rend le développement d'un vaccin efficace encore plus complexe et vital.
Verywell Health: Ce virus mute-t-il à un rythme normal par rapport aux autres virus?
Dr Robinson: Le SRAS-CoV-2 semble accumuler environ deux mutations par mois en moyenne, un taux deux à quatre fois plus lent que celui de la grippe. L'objectif est maintenant d'apprendre comment les différentes variétés nous répondent et de plonger plus profondément dans ces variantes.
Verywell Health: Une mutation potentielle identifiée par les scientifiques a été liée à des cas plus bénins de COVID-19. Cela signifie-t-il que les mutations peuvent être bonnes?
Dr Robinson: Il y a eu une mutation documentée qui semble en fait affaiblir le virus. L'infection par une souche virale contenant une délétion de 29 nucléotides peut réduire la gravité du virus. Il a été décrit comme conduisant à une probabilité plus faible de patients nécessitant un supplément d'oxygène et peut également avoir des taux de réplication plus faibles.
Nous apprenons encore pourquoi un virus plus faible ne disparaîtrait pas simplement. Avoir une version «plus faible» d'un virus pourrait avoir des avantages et des risques pour nous. Le virus plus faible peut ne pas nous rendre super malades, mais il augmente la possibilité d'infecter plus de personnes. Nous pouvons également ne pas développer une réponse immunitaire suffisamment forte, empêchant ceux qui ont été infectés de créer suffisamment d'anticorps.
Verywell Health: Comment les mutations du SRAS-CoV-2 affectent-elles les développements de vaccins?
Dr Robinson: C'est une question essentielle lorsque l'on réfléchit à l'élaboration des meilleures stratégies vaccinales. Nous aurons probablement besoin d'une combinaison d'approches si l'objectif est d'arrêter la propagation du virus. Un vaccin ciblant un antigène viral spécifique peut ne pas suffire.
Nous sommes également en train d'apprendre l'innocuité et l'efficacité des nouvelles technologies vaccinales qui doivent être vérifiées avant d'être administrées à grande échelle. Trouver des moyens de développer une réponse immunitaire avec l'ampleur et la profondeur appropriées pour submerger et neutraliser le virus sera la clé pour développer une immunité adéquate pour soutenir l'immunité du troupeau. Nous devons savoir si ces nouvelles souches et mutations affaibliront notre réponse à la vaccination.
Verywell Health: Quelle est la chose importante que les gens doivent savoir concernant les mutations?
Dr Robinson: Nous devons tous continuer à vivre notre vie comme si nous risquions d'être infectés. Même si vous avez déjà eu une infection au COVID-19, continuez à vivre votre vie comme si vous couriez un risque aussi élevé que n'importe qui d'autre. Les données émergentes sur les mutations et les réinfections devraient nous amener à nous méfier de l'idée des «certificats» ou «passeports» d'immunité, où ceux qui ont déjà été infectés n'ont plus besoin de respecter les mêmes directives que ceux qui sont encore naïfs vis-à-vis du virus. . Nous devrions tous continuer à nous concentrer sur l'utilisation de tous les outils dont nous disposons pour nous protéger et protéger nos communautés.
